近日,我校细胞治疗产业学院施明教授团队在Heliyon(中科院二区,IF=3.4)发表题为“CRISPR screens in mechanism and target discovery for AML”的综述文章,郑骏年、曹江以及施明教授为通讯作者,博士研究生林添为第一作者。
CRISPR screens,也称为全基因组CRISPR或高通量基因编辑技术。该技术基于CRISPR-Cas9系统,通过构建sgRNA文库,可以同时对多个细胞的不同基因进行编辑,在高通量水平上研究表型功能丧失基因,实现“精准的大海捞针“。急性髓系白血病(Acute Myeloid Leukemia, AML)是一种起源于骨髓中的恶性克隆性疾病,其特征是骨髓中原始髓系细胞的异常增殖和分化阻滞,导致正常骨髓被恶性细胞所取代,进而导致正常造血功能失效。近年来,AML的治疗取得了一些进展,但其治疗后易复发。彻底、有效的治疗仍然极具挑战性,许多谜团仍有待解开。
最近,一些研究团队基于CRISPR screens具有随机性和无偏倚性的特点,利用该技术发现众多前所未知的AML效应基因。这些基因包括AML起始和分化相关基因、表观遗传调节因子、线粒体相关基因、代谢酶和非编码RNA、合成致死基因和克服耐药性相关基因等。本文从sgRNA文库、筛选所用细胞类型、Readout、发现的靶基因以及分子机制等方面总结了目前已有的报道,并讨论了这一快速发展领域的挑战和可能的解决方案。本综述对探索新的AML靶点以及开发改善患者预后的新疗法有重要的参考价值。
这项工作得到了中国国家自然科学基金、江苏省自然科学基金、江苏省大学国家科学研究、徐州市重点研究与发展计划的支持。